Олег Шпынов

Биография

Олег руководит группой бионформатики в лаборатории JetBrains Research. Работает в лаборатории с 2013 года.

В 2008 году Олег с отличием окончил математико-механический факультет СПбГУ. В 2008-2010 гг. обучался в аспирантуре СПбГУ. Является выпускником первого года Института Биоинформатики в 2012г.

Ранее Олег принимал участие в разработке основных продуктов JetBrains, включая флагманский продукт IntellIJ IDEA, PyCharm, а также IdeaVIM (плагин эмуляции vim, 7+млн загрузок). Создатель интегрированной среды разработки для языка Ruby - Rubymine. Занимался анализом исходного кода на языке программирования начиная с лексического анализа, заканчивая разработкой систем типов и различных семантических верификаций кода.

Научные интересы включают машинное обучение, анализ данных и биоинформатику.

Олег читает курс "Эпигенетика" для международной магистерской программы Биоинформатика и системная биология в ИТМО, "Бионформатические методы анализа эпигенома" в Инстутуте Биоинформатики, а также руководит научными работами студентов в Институте Биоинформатики, Высшей школе экономики и Computer Science центре.

Профессиональная деятельность

Научное руководство

More than 10 projects including 2 master dissertations were successfully defended under Oleg's supervision.

Проекты

  • SPAN Peak Analyzer and JBR Genome Browser can be used separately as general-purpose peak caller and genome browser, respectively. However, together, they can serve as a complete solution for peak calling. The semi-supervised peak calling approach is capable of improving peaks consistency in datasets with different signal-to-noise ratio, as well as obtaining the best peak calling results for individual samples.
  • Automated Ishikawa Fishbone Diagram construction for epigenetics data
  • Полуавтоматический инструмент для поиска пиков
  • JBR - многоцелевой геномный браузер, с возможностью поиска пиков, множественных позиций итд.
  • Pubtrends is a new scientific publications analysis service. http://bit.ly/pubtrends
  • CMeth Завершен
    CMeth - это инструмент для сравнения и анализа данных полногеномного бисульфитного секвенирования

Публикации

  • BioLabs Руководитель группы